科学家开发猴种系VDJ等位基因综合数据库

2021-01-27 09:25:57 来源:中国科学报

  瑞典卡罗林斯卡学院Gunilla B. Karlsson Hedestam团队开发出恒河猴和食蟹猕猴的种系VDJ等位基因综合数据库。相关论文近日在线发表于《免疫》。

  据研究人员介绍,定义个体中特定的种系免疫球蛋白(Ig)等位基因是解析抗原特异性抗体应答的发生和发展的第一步。恒河猴和食蟹猕猴是临床前研究的重要动物模型,主要分为4个亚组:印度和中国的恒河猴以及毛里求斯和印度尼西亚的食蟹猕猴。

  研究人员开发了Ig基因推断工具IgDiscover,并进行了广泛的基因组验证,从而定义了这4个亚组中的种系VDJ等位基因,总共包括45只猕猴。在中国和印度起源的恒河猴之间,以及在两个恒河猴物种之间,存在等位基因重叠。由于受岛屿限制,毛里求斯食蟹猕猴种群的亚群等位基因数量最少,但个体等位基因多样性却很高。这些基因库为重要临床前模型中的B细胞应答研究提供了资源。

  相关论文信息:

  https://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.12.018


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