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肿瘤和T细胞对检查点抑制敏感机制获揭示
https://cheman.chemnet.com/ 2021-02-01 11:35:25 中国科学报
英国弗朗西斯·克里克研究所Charles Swanton、伦敦大学学院癌症研究所Nicholas McGranahan和Sergio A. Quezada研究组合作，通过荟萃分析揭示了肿瘤和T细胞对检查点抑制敏感的内在机制。相关论文1月27日在线发表于《细胞》。
研究人员利用标准化的生物信息学工作流程和临床结果标准，对7种肿瘤类型超过1000例检查点抑制剂(CPI)治疗患者的全外显子和转录组数据进行了核对，以验证CPI敏感性的多变量预测因子。克隆性肿瘤突变负荷(TMB)是CPI反应的最强预测因子，其次是TMB和CXCL9的总体表达水平。TMB亚克隆、体细胞拷贝改变和组织相容性白细胞抗原进化分歧未能达到显著的泛癌预测。
二核苷酸变体被认为是氨基酸自由基取代和与增强型肽疏水性/免疫原性相关免疫原表位的来源。拷贝数分析证明了先前功能研究发现的另外两个决定CPI敏感性的因素：与反应相关的9q34丢失和与耐药性相关的CCND1扩增。最后，新抗原反应性CD8肿瘤浸润淋巴细胞的单细胞RNA测序(RNA-seq)结合对CPI响应肿瘤的大量RNA-seq分析确定了CCR5和CXCL13是T细胞CPI敏感的内在标志物。
据悉，CPI可增强适应性免疫。系统性全肿瘤分析可能揭示CPI敏感肿瘤细胞内在和微环境特征的相对重要性。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.002
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