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碱基编辑筛选揭示DNA损伤反应变体功能影响
https://cheman.chemnet.com/ 2021-02-22 08:34:22 中国科学报-《细胞》
美国哥伦比亚大学Alberto Ciccia研究团队通过碱基编辑筛选对DNA损伤反应变体进行了功能研究。2月18日出版的《细胞》发表了这项成果。
通过CRISPR依赖的胞嘧啶碱基编辑筛选，研究人员鉴定出超过2000个sgRNA，它们在86个DNA损伤反应(DDR)基因中产生核苷酸变体，从而导致DNA损伤后细胞适应性发生改变。在这些变体中，研究人员在DDR调节因子53BP1的Tudor域中发现了功能丧失和功能获得的突变体，并定义了结合去泛素化酶USP28所需的非经典表面。
此外，研究人员表征了TRAIP泛素连接酶的变体，并定义了一个结构域，其缺失使细胞对拓扑异构酶I的抑制具有抗性。
最后，研究人员确定了具有相反基因组稳定性表型的ATM激酶突变，以及先前被归类为对乳腺癌意义不明的变异的CHK2激酶功能丧失性突变。
研究人员认为，该资源将有助于发现其他DDR基因功能，并加快人类疾病中DDR变体的研究。
据介绍，DDR基因的突变危及基因组完整性，并易患癌症和遗传疾病。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.041
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