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全局分析T细胞特异性可发现抗原
https://cheman.chemnet.com/ 2021-03-15 08:24:52 中国科学报
美国斯坦福大学Mark M. Davis研究团队发现，人类非小细胞肺癌中共有T细胞特异性的全局分析可实现HLA推测和抗原发现。该研究成果近日发表于《免疫》。
为了鉴定具有共享抗原特异性的疾病相关T细胞受体(TCR)，研究人员使用GLIPH2算法分析了178名非小细胞肺癌患者的778938个TCRβ链序列。研究人员确定了超过66000个共有特异性组，其中435个与相邻肺相比在克隆中扩展并富集了肿瘤。使用个文化酵母多肽展示文库，研究人员鉴定了一组富集肿瘤特异性的抗原表位。这其中包括一条来自上皮蛋白TMEM161A的多肽，这个多肽在肿瘤中过表达并且是爱泼斯坦—巴尔病毒和大肠杆菌的交叉反应性抗原决定簇。
这些发现表明，这种交叉反应可能是肿瘤浸润中病毒特异性T细胞存在的基础，而病原体交叉反应可能是多种癌症的特征。
相关论文信息：
https://doi.org/10.1016/j.immuni.2021.02.014
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