新加坡南洋理工大学Sanjay H. Chotirmall课题组揭示支气管扩张症加重时期的微生物组学图谱。相关研究近日在线发表于《自然—医学》。
研究人员提出了一种通过加权相似性网络融合在支气管扩张中整合细菌、病毒和真菌群落的多基因组方法。恶化风险最大的患者在其气道微生物组中具有较少的复杂微生物共现网络、多样性降低和拮抗作用程度较高。此外,纵向相互作用组动力学揭示了病情加重期间的微生物拮抗作用,这种相互作用在其他稳定的多基因组治疗后得以解决。
对假单胞菌相互作用基因组的评估表明,相互作用网络(而不是单独的丰度)与恶化风险相关,并且微生物相互作用数据的纳入改善了临床预测模型。霰弹枪宏基因组测序的独立队列验证了在靶向分析中检测到的多基因组相互作用,并证实了其与病症恶化有关。综合微生物组学可捕获微生物相互作用以确定加重风险,单个微生物组的研究无法检测到这一点。抗生素策略可能针对相互作用网络而非单个微生物,从而为了解呼吸道感染提供了一种新方法。
研究人员介绍,支气管扩张是一种进行性慢性气道疾病,其特征是微生物的定植和感染。
相关论文信息:
https://doi.org/10.1038/s41591-021-01289-7
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