美国杰克逊基因医学实验室Chia-Lin Wei、Roel G.W. Verhaak等研究人员合作发现，致癌性染色体外DNA可作为移动增强子全面放大染色体转录。该项研究成果近日在线发表于《癌细胞》。
研究人员利用ChIA-PET和ChIA-Drop染色质相互作用测定来表征了影响癌症转录程序的全基因组染色体外环状DNA(ecDNA)介导的染色质接触。胶质母细胞瘤患者来源的神经球和前列腺癌细胞培养物中的ecDNA具有广泛的ecDNA内部和全基因组染色体相互作用的特征。ecDNA—染色质接触灶的特征在于广泛的高水平H3K27ac信号，主要集中在表达水平提高的染色体基因上。前列腺癌细胞具有由特征增强子组成的合成ecDNA环，导致染色体基因转录的全基因组激活。
以单分子分辨率解析ecDNA的染色体靶标表明，在ecDNA指导的相互作用网络内的空间聚集与活跃表达的癌基因直接存在关联。这些结果表明，ecDNA可以作为移动转录增强子来促进肿瘤进展，并在癌症中显示出潜在的合成非整倍体转录调控机制。
据介绍，ecDNA作为癌症基因组中的一种普遍存在但表征不多的致癌性改变而出现。
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https://doi.org/10.1016/j.ccell.2021.03.006
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