澳大利亚沃尔特和伊丽莎·霍尔医学研究所Shalin H. Naik及其小组,利用克隆多组学揭示了Bcor在紧急情况下树突状细胞(DC)发育中的负调控作用。日前,这一研究成果在线发表于《免疫》。
研究人员开发了克隆多组学,其中克隆产生的子代充当母体的替代物,从而实现对每个克隆进行多个独立测定。使用SIS-seq,可以通过RNA测序检验平行“姐妹”分析中克隆同胞的基因表达或在细胞培养中的命运轨迹。研究人员鉴定并使用CRISPR验证了调控不同DC亚型命运的偏倚基因。这包括在Flt3配体介导的紧急情况下DC的形成过程中,Bcor是浆细胞样DC(pDC)和常规DC2型(cDC2)的抑制因子。
随后,研究人员研发了SIS偏倚程序,以并行检查同一克隆的野生型和Bcor缺陷型细胞的发育。研究发现对于cDC2,Bcor限制了克隆扩增;而对于pDC,Bcor抑制了克隆命运的潜能。因此,SIS-seq和SIS—偏倚可以揭示支配克隆命运的分子和细胞机制。
研究人员表示,尽管单细胞多组学技术有所进步,但其对单个干细胞或祖细胞只能进行一次测序。
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https://doi.org/10.1016/j.immuni.2021.03.012
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